Biudžetinė įstaiga formuoja valstybės politiką asmens sveikatos priežiūros, visuomenės sveikatos priežiūros, įskaitant alkoholio, narkotikų ir tabako kontrolę, farmacinės ir kitos veiklos, susijusios su farmacijos produktais, privalomojo sveikatos draudimo srityse, organizuoja, koordinuoja ir kontroliuoja jų įgyvendinimą, o įstatymų numatytais atvejais – juos įgyvendina sveikatos apsaugos ministrui pavestose valdymo srityse.